Prowadzący instalację objętą obowiązkiem uzyskania pozwolenia zintegrowanego powinien na bieżąco śledzić prace dotyczące nowych albo aktualizowanych konkluzji BAT. Ich publikacja uruchamia obowiązek sprawdzenia, czy instalacja spełnia nowe wymagania oraz czy konieczna będzie zmiana pozwolenia zintegrowanego.
Konkluzje BAT określają najlepsze dostępne techniki dla danej branży lub rodzaju instalacji. Są one poprzedzone opracowaniem dokumentu referencyjnego BREF, który opisuje stosowane technologie, poziomy emisji, zużycie surowców, energii i wody oraz rozwiązania ograniczające oddziaływanie instalacji na środowisko.
Po publikacji konkluzji BAT prowadzący instalację powinien sprawdzić, czy warunki określone w pozwoleniu zintegrowanym oraz rzeczywisty sposób eksploatacji instalacji są zgodne z nowymi wymaganiami. Organ właściwy do wydania pozwolenia zintegrowanego ma obowiązek przeanalizować warunki pozwolenia niezwłocznie po publikacji konkluzji BAT, nie później niż do 6 miesięcy od ich publikacji. O przystąpieniu do analizy organ powiadamia prowadzącego instalację.